Aquí se explicara el porque de "La Nueva Era".
Hacia tiempo en que Akatsuki había sido destruido, al igual que Taka, las aldeas estaban en paz por un tiempo, Los Jinchurikis de ese entonces, habían muerto, siendo capturados por Akatsuki, excepto Naruto, el cual venció a Akatsuki, y dejo en libertad a los Bijus, poco después, Naruto libero al Kyubi. Estos Bijuus desaparecieron un tiempo, pero había un ninja que tenia nuevos planes para el, intentaría formar de nuevo a Akatsuki, y capturar a los bijuus, ¿Para que? Su porque era desconocido, nadie conocía a ese ninja, o eso pensaba, mientras que por otro lado, otro ninja planeaba algo en especial, reviviría la organización Taka, para sus privilegios, conseguiría nuevos ninjas, y cumpliría su destino...
En tanto en las aldeas, algo ocurría, los bijuus atacaban las aldeas, siendo capturados por unos sabios en unos pequeños recién nacidos, ¿Que pasaba? ¿La historia se repetiría? se preguntaba la gente, mientras veía como la historia de los bijuus se repetia, pero algo cambiaba, los antiguos ninjas, Naruto, Sasuke, Sakura, Gaara, Nagato, y el resto, habían muerto hace unos años, ¿Que pasaria ahora? Unos nuevos ninjas resurgirían, de entre los clanes, Ninjas con poderes únicos, y una maldición... Estos ninjas poseían un Bijuu, estos ninjas eran de distintas aldeas, pero había algo mas, a demás de los Bijuus....
La Guerra Ninja había comenzado, aldeas contra aldeas, en busca de poder, todos necesitaban el poder de los bijuus, tanto para protección, para ser grandes potencias.
¿Que pasara ahora?
La historia se reescribe, pero de otra forma, ¿el futuro sera igual al pasado?, Eso solo lo deciden los Ninjas, ellos deberán reescribir la historia, al mismo tiempo que protegen sus aldeas, y algo mas.... Mientras se protegen ellos mismos, ¿ Podrán superar esta nueva era Ninja? Todo depende de ellos...